ENAP ha centrado sus actividades de investigación y desarrollo (I&D) en el campo de las energías renovables no convencionales (ERNC), particularmente en geotermia y biocombustibles de segunda generación (biodiesel fabricado a partir de desechos forestales).
Geotermia
En el campo de la geotermia, ENAP forma parte de dos sociedades que se encuentran investigando la potencialidad de este recurso renovable: En asociación con la compañía italiana ENEL, Empresa Nacional de Geotermia S.A. y Geotérmica del Norte S.A., participando nuestra empresa con el 49% en cada una de ellas. Estas empresas tienen como objetivo aprovechar la energía geotermal que emana del subsuelo para diversos procesos productivos, sea a través de la producción de electricidad como del uso de vapor de agua.
Biocombustibles
ENAP se encuentra investigando la factibilidad de producir en el país combustibles de segunda generación, a través de dos entidades en las que participa como socio: ForEnergy y Biocomsa. Ambos consorcios se propusieron un plazo de 5 años para presentar soluciones tecnológicas, a partir de biomasa forestal, que alcancen altos niveles de impacto en la obtención de biocombustibles de última generación, mediante la adopción, transferencia y comercialización de sus resultados.
Biocomsa es un consorcio formado en 2008 por la filial de ENAP, Enap Refinerías S.A., por Consorcio Maderero y la Universidad de Chile. Su objetivo es buscar soluciones técnicas y científicas en el ámbito bioenergético en Chile, orientando su labor a la investigación y desarrollo para su posterior comercialización a empresas que requieran de estas tecnologías.
Se inició como proyecto bajo el alero de Innova Chile y se ha fijado ocho líneas de investigación. Cada subproyecto tiene productos, objetivos e hitos que han sido presentados y aprobados por Innova Chile. Paralelamente, el Consorcio tecnológico, deberá ir planteando e implementando nuevas líneas de trabajo y de productos que garanticen su viabilidad. Esa es la idea de los Consorcios Tecnológicos.
En este Consorcio se comparte la experiencia, los recursos y conocimientos, para crear valor a través de la investigación aplicada. De hecho, la Universidad de Chile cuenta con un amplio desarrollo en el área de investigación forestal y en procesos orientados a la generación de energía a partir de material lignocelulósico.
El objetivo esencial de Biocomsa es la investigación aplicada y no está entre sus objetivos potenciarse como un ente productivo.

ForEnergy fue constituida en 2007. Es una sociedad orientada a la producción de biodiesel de segunda generación, a partir de biomasa forestal y a la captura de oportunidades de negocios.
El biodiesel de segunda generación, por sus características intrínsecas, es considerado un hidrocarburo, y puede ser utilizado en cualquier porcentaje de mezcla con el diesel proveniente de una fuente fósil. De esta forma, si fuese económicamente viable, lo que entre otros elementos va a ser abordado por las investigaciones que se van a emprender, es posible pensar, en un futuro, en el biodiesel de segunda generación como componente relevante de la matriz energética de Chile.